在蛋白质组学和靶向代谢组学等生命科学研究中，精确定量低丰度分子至关重要。质谱（Mass Spectrometry, MS）技术中，SRM（Selected Reaction Monitoring）和PRM（Parallel Reaction Monitoring）是两种主流的靶向定量策略，广泛应用于生物标志物验证、药物代谢研究及临床转化研究等领域。那么，PRM和SRM究竟有何区别？本文将从原理、仪器依赖、数据特征、应用场景等方面系统对比这两种技术，帮助科研人员根据实验需求做出最优选择。

一、PRM与SRM的核心区别

1、质谱平台不同

（1）SRM 使用三重四极杆质谱（Triple Quadrupole），在Q1筛选前体离子，在Q2碰撞碎裂，在Q3检测特定产物离子。

（2）PRM 则使用高分辨质谱（如Orbitrap），在筛选前体离子后，通过HCD碎裂后，对所有产物离子进行全谱扫描。

2、数据采集方式

（1）SRM 依赖预设的离子对（transitions），检测特定的前体-产物离子组合。

（2）PRM 对所有产物离子同时采集，无需手动选择transition，信息更全面。

3、方法开发与通量

（1）SRM 方法开发繁琐，每个肽段需优化多个离子对，适合已知目标但通量低。

（2）PRM 方法开发简单，采集更灵活，支持多个靶标并行定量。

4、分辨率与特异性

（1）SRM 分辨率较低，易受共洗脱物干扰。

（2）PRM 依托Orbitrap高分辨能力，可有效区分干扰峰，提升定量准确性。

5、定量准确性与重现性

（1）PRM 在多中心研究、临床验证中表现出更高的数据一致性与稳定性。

（2）SRM 更适合工业环境中高通量、大批量、重复样本的定量。

二、SRM：三重四极杆平台上的经典定量技术

SRM是一种基于三重四极杆质谱（Triple Quadrupole, QQQ）的靶向定量方法。其工作流程包括：

1、前体离子选择（Q1）：第一个四极杆筛选目标肽段的母离子（Precursor Ion）。

2、碰撞诱导解离（CID）：在碰撞室（Q2）中母离子断裂生成碎片离子。

3、碎片离子筛选（Q3）：第三个四极杆仅检测特定的产物离子（Product Ion）。

每一对前体-碎片组合称为一个“转itions（Transition）”，研究者需事先优化每个转itions的参数。由于每次只能监测一个转itions，SRM的通量相对较低，但其定量灵敏度高、背景干扰少，是目前FDA认可的蛋白质定量“金标准”之一。

二、PRM：Orbitrap平台上的高分辨率革新

PRM是依托高分辨率质谱（如Orbitrap或Q-TOF）开发的新一代靶向定量方法。其流程如下：

1、前体离子选择：由四极杆（Q1）选择目标母离子进入碎裂室。

2、碎片离子检测：所有碎片离子被同时送入高分辨率分析器（如Orbitrap）进行全面检测。

与SRM不同，PRM不需预定义转itions。在一个扫描周期内即可获取完整的碎片离子谱图，极大提高了数据通量和后处理灵活性。

三、PRM vs SRM：核心差异全解析

四、选择哪种技术？应用场景决定一切

1、适合SRM的场景：

（1）临床样本中极低丰度蛋白质或代谢物的精准定量

（2）FDA或GLP要求的规范实验，需使用认证平台

（3）样本背景复杂，需高度特异性与低背景干扰

2、适合PRM的场景：

（1）多靶点并行分析，如验证多个生物标志物

（2）探索性实验中，需保留数据进行后期深度挖掘

（3）快速开发和验证新靶点的方法学研究

百泰派克生物科技结合Thermo Orbitrap系列质谱平台和自主优化的靶向分析流程，提供涵盖PRM和SRM的全套定量服务。我们支持：

（1）多组织来源样本的定量检测（血清、组织、细胞等）

（2）个性化靶点筛选与方法开发

（3）数据可视化与生物信息学解读

无论您需要GLP级别的标准化定量，还是希望快速开展探索性靶向实验，我们都能提供定制化服务，助您高效推进项目进展。SRM与PRM虽然技术路径不同，但本质上都是服务于精准定量的强大工具。前者更适合规范化、低通量场景，后者则在灵活性与数据重挖掘方面独具优势。科研人员应根据研究目标、样本类型和预算综合考量，选择最适合的策略。百泰派克生物科技深知每一个定量实验背后都承载着科研的严谨与创新。欢迎联系我们，让我们以专业技术助力您的科研突破。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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